I batteriofagi sono virus in grado di infettare I batteri; si utilizzano quando il frammento di DNA da clonare è troppo  grande per utilizzare vettori plasmidici ( librerie di DNA).

Viene definito operone l’insieme di geni regolati in modo coordinato. L’organizzazione dei geni in operoni è un elemento di fondamentale importanza per la regolazione genica dei procarioti: gli operoni contengono, oltre ai geni che devono essere trascritti, sequenze siti di controllo, che attraverso diversi meccanismi regolano l’espressione dei geni dell’intero operone.

La sintesi del filamento ritardato richiede un corto primer che verrà rimosso; alla fine del cromosoma non c’è modo di sintetizzare questa regione quando è rimosso l’ultimo primer. Pertanto il filamento ritardato è sempre più corto rispetto al suo modello di almeno la lunghezza del primer. Questo è il cosiddetto “problema di fine replicazione”.